在我国高校中，每当提起巨无霸高校时，大家首先想起的就是川山吉（四川大学、山东大学、吉林大学）、武大、华科、中南等高校，这些高校在校学生人数都超过5万人，教职工人数和论文发表数量也非常可观。

这些巨无霸高校之所以规模庞大，大都源于本世纪初的几次大规模高校合并。1992年起，由于观念上的转变，以及苏联解体等影响，中国逐渐开始了高等教育管理体制改革和布局结构调整，即由原先的苏联模式向欧美模式（主要是美国模式）转变。

加之当时相当一部分高校存在着规模偏小、机构臃肿、部门重叠、教企不分、行政人员多于专职教师、尊师重教落不到实处等等弊端。为了实现教育减负、迅速发展，与国际教育体制接轨同步，中国高等教育届掀起了一场声势浩大的合并飓风。

上世纪90年代的院校合并飓风

1998年9月15日，设在杭州的浙江大学得风气之先，与杭州大学、浙江农业大学、浙江医科大学合并，组建成学科设置、办学规模在全国名列前茅的新浙大，在此之后，类似的高校合并消息接踵而至。
“新武汉大学”、“新吉林大学”、“新山东大学”、“新四川大学”等一批新综合性大学相继出现，“大而全”一时之间几乎成为中国高等教育的主题。

39所985高校里面，只有中国人民大学、北京师范大学、北京理工大学、中央民族大学、北京航空航天大学等13所高校没有合并过，其余26所高校都有过合并历史，西北农林科技大学甚至合并了7所高校和科研所。

即便是在许多人眼里非常“小而精”的中国科学技术大学也有合并史。2000年左右，中科大合并了中国唯一的烟草类大学